告别了大木博士后，小智带着小瑶去了解宝可梦中心，有交换情报的也有为训练家提供休息房间的
“哇，好好吃哦，感觉这里什么都有”正在吃着咖喱饭的小瑶惊叹道
“这里只是沿途让我们休息的地方”小智回答道
“只要是训练家都可以来住吗？”小瑶疑惑道
这是不可能的，对于联盟来说，是一笔巨大的开销，对于商业联盟来说，不可能有白吃的午餐，开销都在成为训练家前交了
“嗨，两位，你们平安来到了”一个端着盘子的中年男人走了过来
“你是之前的那个好心的路人”小瑶回答道
在吃饭中了解到他叫梅兹，在这里研究古代神奇宝贝
“教授，这个遗迹就是山丘上那个地方吗？”小智疑惑的问道
“是啊，为了研究那个古辰遗迹，我特别在这个神奇宝贝中心设立研究所，而遗迹上面有个石室，传说是连接古代神奇宝贝和我们世界的门非”
“门非?”小瑶疑惑道
“那个构造很神奇，现在进去”
“古代神奇宝贝又是什么？”小瑶再次发出疑问
“不同于化石神奇宝贝，古代神奇宝贝是指存在于古代到现在，没有变过样子的神奇宝贝”
古代的神奇宝贝经过数亿年的转变才变成现在的样子，化石神奇宝贝则是利用机器还原古代神奇宝贝，但这难免有偏差，没有因环境而改变的神奇宝贝生命力都很强
不过大多数存留下来的，小智认为生存在海洋里的偏多，地球经历过冰河时代等，地面上大气稀薄，在水里的神奇宝贝更好生存
此时，外面有一群穿着红色衣服的人正在用着热成像仪观察着小智他们，拿着热成像仪对着通讯器道“开始行动”
忽然神奇宝贝中心的灯黑了，梅兹的研究室冲进来几个带着红目镜身边有几只黑鲁加的人
“你们是什么人？”梅兹教授警惕的问道
“教授，我想要麻烦你和我们去遗迹走一趟”领头的小兵对着梅兹教授道
“梅兹教授”乔伊跑着过来刚想说明，情况就被人控制
由于不清楚情况，小智并没着急动手，梅兹教授为了大家不受伤害便同意了要求
“没有电的话，还在治疗的神奇宝贝就会有危险”被关着的乔伊小姐担心道