年底的初期统计，全国天主教会办的普通男校有3518所,学生83757人；女校2615所，学生53283人；师范学校 16所，学生612人。上个世纪 50年代以后在上海设立的徐汇女学、明德女学、类思小学、圣芳济学堂和在天津、汉口设立的法汉学堂，都具有一定的代表性。
高等学校有1903年法国耶稣会在上海设立的震旦大学，许多教区还曾设立孤儿院、启蒙学校和教授高初中课程的“高等学校”，许多修院也培养男女修生。
基督教学校的产生，首先是 1818年英伦敦会传教士r.马礼逊在马六甲设立的英华书院。
鸦片战争以后，正教会、伦敦会在厦门,北长老会在广东,公理会和英圣公会在福州、 宁波、 上海，巴色会和礼贤会在广东，英长老会在厦门、汕头、台湾，美以美会在福州、江苏、浙江以及华中、华北、华西，循道会在两广、两湖，浸礼会在山东、宁波，内地会在西北、西南省份，南长老会在江苏、浙江，公谊会在四川，基督教会在南京、上海，浸信会在两广，贵格会在江苏、安徽，英美会在四川，来复会在安徽、江苏,遵道会在湖南,信义会在两湖各地，都先后设立规模不等的义学、主日学、日间学校、寄宿学校以及以“英华”、“中西”、“格致”、“三一” 等命名的学堂或书院。
外国教会凭借了这些学校，可是将触手伸到了中国的无数角落，甚至是偏远地区。
1844年“东方妇女教育促进会”女传教士亚尔德西在宁波设立的女校， 1850年英圣公会在香港设立的圣保罗书院，1853年公理会教士卢公明在福州设立的格致书院，1864年美长老会教士狄考文在山东登州设立的文会馆（中经广文大学堂发展为齐鲁大学），1881年美以美会教士林乐知在上海设立的中西书院(后与苏州博习书院合并成立东吴大学)，都是早期具有代表性的普通学校此外还有师范学校职业学校（包括农业、护士、商业）以及不列入学制系统的盲、聋、哑学校，孤儿院等。
根据去年年底初期统计，全国基督教高初级小学6599所，学生184481人，中学校291所，学生15213人。
1890年新教传教士上海会议后,教会确定新方针,把着重点放在高等教育方面。除外，教会办的其他高等学校都是在20世纪正式成立和发展起来的，如东吴大学 1901 年设立于苏州，文华大学（原博文书院设大学部）1903年设立于武昌，夏葛医科大学（后改为夏葛医学院）1905年设立