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五队为一旅，设立参领管理。五旅为一佐，设副都统管理。诸部头人受封为同知，只能管民务。军务则由朝廷从诸部之中，挑选的将军管理。诸部头人，只有管理本旗民务的权利。并不能干涉州府权利。其属下旗民可以享受不缴纳钱粮的权利，但必须要完全服从朝廷征调。
并且在当地设置官府，治理汉人或是渤海人。对其子弟学习汉文优秀者，则采取恩萌入仕的办法授予官职。并从其诸部子弟之中，挑选优秀子弟送到国子监学习一定时日后，授予官职。这一种即与青塘吐蕃诸旗有些类似，但又不完全相同的办法。是在黄琼离开辽阳府之前，黄瑞枫反复与其商量之后决定的。这其中其中还采取了部分，北辽对这些民族的治理手段。
活动在按出虎水流域的女真完颜部，在黄瑞枫宣布这个处置办法后，其几部首领当即便拒绝了朝廷的条件。为了给女真与室韦诸部以警示，黄瑞枫事后便调集重兵，将完颜三部彻底剿灭。俘获的女子赏赐给有功将士为妾，男子则全部斩杀。整个完颜三部，被杀了一个干干净净。其他诸部，便是心有不甘。但再也不敢与朝廷对抗，老老实实接受朝廷的册封与安置。
黄瑞枫又与诸部首领约定，其头人每三年到京城面君。这又拉又打，还采取了杀一只猴子，震慑群鸡的做法，将北方诸部稳定下来。同时，在北方诸部族之中，大力推广佛教。对于大漠草原上的诸部，则推行青塘吐蕃的盟旗制度。鼓励其改变原本信仰的萨满教，改为信仰喇嘛教。对于信仰喇嘛教的部族，朝廷在设置盟旗方面，将会给与一定的照顾，俸禄上也多。
相对于大漠草原与白山黑水诸部，杨继元虽说打退了高丽对保州进攻，并攻下了北辽设置在辽东最后一块地盘镇海府诸州县。但在接下来对高丽本土的进攻之中，却是遇到了高丽军的顽强抵抗。尽管利用大炮的优势，连续攻下了高丽数座城池，甚至攻下了高丽西京，并全歼八千高丽援军，可总体上推进还是有些缓慢。而且在行军途中，还多次遭遇到高丽军设伏。
失去耐心的杨继元，于当年季风起。调集已经进驻山东路的一万步军、三千马军，由从大理国调回后，便任山东水师提督张天德亲自指挥。扬帆出海，从山东路渡海北上。面对海州严密死守高丽军，张天德也不屑与其争夺。将所辖舰艇调头，以侧舷舰炮直接就是一排炮弹上去。一顿霹雳震天弹加上实心弹下去，高丽海州守军以及那点水师，连点浪花都没有掀起。
在拿下海州后，担心开京高丽君臣，像北辽三次征伐那般开溜的