同时也通过此举将瞿式耜编入自己近卫军体系。
方以智是复社成员，且翰林院臣，虽对于西学颇有研究，但不及毕懋康专注于技术型研究，偏于理论研究，朱由检也就没有让他参与军械所的工作，而是打算让他主持大明科学院的组建工作。
作为明末四公子之一，又高中过进士，还是翰林官，方以智在大明学界的影响力与人脉，尤其是在江南一带，自然是无人能及，让方以智号召天下杂学之士组建大明科学院，自然会起到事半功倍的效果。
而艾儒略对于枪炮铸造和研制倒不是很专业，据瞿式耜上奏，此人善于地理，尤其是测绘一道，《万国全图》便是此人与杨廷筠等人合作完成。
朱由检本着人尽其才的目的，也派锦衣卫去将此人召进京中参与地理测绘一事。
不过，指望此人在军械所有什么帮助没什么可能了，朱由检现在只能用一个人，便是眼前的汤若望。