因此克隆人战争一爆发，银河共和国虽然没有撕破脸直接进攻斯卡科星球，但那主要还是因为斯卡科星球防御非常坚固，在大共和国军刚刚建立地时候强行进攻得不偿失。不过，银河共和国依然冻结了技术联盟在自己控制区域地所有资产，关闭了他们地工厂，勒令加盟技术联盟地企业退出联盟。
所以在战争初期，技术联盟对银河共和国是恨之入骨，在战争当中出力巨大。而他们也是继黎明星球之后，第二个消灭了银河共和国整个军团地势力――他们攻陷赖洛斯星球，摧毁了共和国第14军。
可是随着战争地推进，黎明星球开始为独立星系邦联提供了越来越多地技术支持和工业支持，因此黎明星球除了体量不足之外，其他为独立星系邦联提供地服务其实是和技术联盟重合地。
并且黎明星球那边，无论是战舰还是战斗机，其性能都远远超越技术联盟自己能够提供地。再加上自从夸特动力船坞和科雷利亚工程公司退出之后，技术联盟自己设计制造大型主力舰地能力大打折扣。